服务介绍Service Overview
我们拥有丰富的虚拟筛选经验，擅长大规模化合物库的批量对接与优先级排序。依托高通量计算集群与AutoDock Vina引擎，精准控制假阳性率，支持靶点定制筛选逻辑，快速交付结合能排名及先导化合物，加速您的药物研发进程。我们专注于药物研发领域的有机小分子虚拟筛选服务，为科研机构与制药企业提供基于AutoDock Vina引擎的高通量蛋白质-小分子对接分析。本服务主要面向有机小分子配体（符合类药物化学规则的化合物），在此范围内可获得最佳的计算结果与生物学相关性。
服务优势Our Strengths
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- 高效稳定
- 自主研发批量对接脚本，支持同时处理数千个配体分子，大幅缩短计算周期，确保结果准确可靠。
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- 信度领先
- 基于AutoDock Vina引擎，优化对接参数配置，结合能预测精度高，重复性好，满足科研发表要求。
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- 数据完整交付
- 提供结合能排名表、Top化合物对接构象及分析报告，数据完整可追溯。
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- 专业团队
- 核心成员具备多年计算生物学经验，熟悉药物筛选流程，可提供从方案设计到结果解读的全流程支持。
服务流程Service Process
库准备与预过滤
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分层对接（粗筛+精筛）
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结果评估
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可视化与报告
客户提供Customer Provided
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- 受体文件（必选）
- 蛋白质PDB文件（需包含完整氨基酸序列）或UniProt ID/PDB ID 如信息未知需说明物种（如Human/Mouse）
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- 配体文件（必选）
- SDF/PDB格式文件，或提供SMILES字符串
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- 关注区域（如活性位点、loop区）
- 明确的结合口袋中心坐标及盒子尺寸或已知活性位点信息
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- 参考抑制剂信息（如有）
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- 计算要求（可选）
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对接模式数量（默认9个）
详尽程度（默认8）
服务说明Service Description
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服务名称 |
服务内容 |
交付内容及标准 |
服务周期(工作日) |
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虚拟筛选 |
单蛋白 vs 100-1000个配体，虚拟筛选 |
配体结合能排名表（按亲和力从高到低排序排名靠前化合物的详细对接结果（含结合能、相互作用残基） |
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案例展示Case Showcase
基于本虚拟筛选流程，从10,027个FDA批准药物中成功筛选出先导化合物Dirlotapide。该化合物经 分子对接、MM/GBSA计算、分子动力学模拟、细胞实验及动物模型验证，对艰难梭菌毒素B(C.diffcile Toxin B,TcdB）四种主要亚型均表现出高效中和活性。（doi:10.1021/acs.jmedchem.5c01483）
联系方式CONTACT US
常见问题FAQ
Q1：一次最多可以对接多少个配体？
Q2：如何确定对接盒子（结合口袋）的位置和大小？
Q3：对接结果的准确度如何？